化學劑對胎兒的傷害是僅次于輻射線的環境因子。這些化學劑充滿在工業與環境污染中，懷孕的人通常在不知不覺中受到危害而不自知。這些會影響到生育及胎兒的化學劑主要是一些會破壞內分泌的化學劑、重金屬、有機溶劑及殺蟲劑等。

　　根據美國一項統計指出，大約有17%的孕婦會在工作場所接觸到造成胎兒畸形的化學劑，且至少有51種人工合成的化學劑證明會造成胎兒畸形。這些會破壞內分泌的化學劑屬于荷爾蒙的類似物，會占據荷爾蒙的接受器或誘發不正常的荷爾蒙反應。例如有些食物當中含有人工合成的女性荷爾蒙和雄性素，這些都容易造成胎兒性器官發育的不正常。

　　ddt殺蟲劑雖然是一種有機氯，但其內就含有女性荷爾蒙的作用，證明會對于鳥類及其它野生動物造成不孕�，F在ddt雖不用，但是以前用的ddt會存在我們的環境中，例如殘留在我們的土壤中而透過食物進入孕婦體內，對于胎兒的影響包括低體重與小腦癥。

　　有些重金屬會跑到土地里而進入食物鏈中，例如藉由土壤及水，讓魚受到污染，而人吃了魚之后就會感染，例如之前曾經爆發有機汞透過魚而對人體傷害的新聞事件。過多的汞會造成神經的傷害，會讓胎兒產生腦性麻痹及小腦癥。

　　現在有很多人用鉛做為染料，報紙中也含鉛，許多公司將鉛丟棄之后，就會跑掉土壤里。根據統計，美國有52%的家庭鉛含量都超過可允許的范圍。若是鉛過量會造成胎兒的死亡以及智能發育的障礙。通常孕婦血中濃度超過每毫升10微克，就會對胎兒造成傷害。

　　鎘也常被用來當成畫畫的原料，因此染料工廠排放廢水造成的污染也時有所聞，例如臺灣曾經發生過的鎘米事件，在動物上鎘會造成胎兒的兔唇、上顎裂、無腦兒、肺部的發育不全或神經的損傷等問題，在人類則有待證實。

　　多氯聯苯（pcb）亦是一例，它是常被用在電子塑料制品或黏著劑的一項原料，雖然現在已不用，但在環境中仍易殘存，因此在魚類、豬、牛肉或乳制品中可能存在，而在攝取過量后會造成不孕、胎兒發育不良、胎死腹中或智能發育不足，孕婦本身也有長期的皮膚痤瘡和色素沉積及甲狀腺功能異常。

　　有機溶劑，例如二甲苯會造成胎兒下肢發育不良。這在日常生活中接觸到的物品如指甲油、發膠、修正液、油漆、松香油等都常具有這些成分。戴奧辛會造成子宮內膜過度增生，降低生育能力以及增加子宮內膜異位癥的機率。殺蟲劑容易造成卵巢功能不良、胎兒臍膨出及先天性心臟病。因此孕婦在工作或居家有接觸到園藝時，要特別提高警覺，殺蟲劑、土壤、干洗劑等物品都有可能造成影響。