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肌酐清除率在臨床上是指腎小球濾過率，兩者在一定程度范圍內可以進行互換，但腎小球濾過率更好地代表腎臟功能。如果腎小球濾過率即肌酐清除率高，說明腎臟功能強大，能將機體代謝廢物以肌酐為標準排出體外，其腎臟功能正常。如果腎小球濾過率即肌酐清除率低，說明腎臟可能出現異常。肌酐清除率和腎小球濾過率有一定的聯系，基本上相等，但是在某些情況下，肌酐清除率和腎小球濾過率還是有區別。腎小球濾過率，只是說明腎小球對肌酐的清除能力，而肌酐清除率不但包括腎小球的肌酐清除能力，還包括腎小管的肌酐清除能力。因為腎小管在血清肌酐升高以后，可以分泌一部分肌酐，特別是當肌酐大于正常值上限的時候，可以分泌一部分多余的肌酐。所以總體而言，肌酐清除率要大于腎小球濾過率，是腎小球濾過率和腎小管分泌率的總和。但是隨著肌酐的升高，當血清肌酐＞2mg/dl的時候，腎小管的肌酐清除能力已經達到飽和。所以肌酐越高，腎小球濾過率和肌酐清除率的值越接近。