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預防呼吸道病毒感染和預防其它傳染病類似，三個環節包括控制傳染源，切斷傳播途徑，保護易感人群。如疾病所有感染者均有癥狀或癥狀較嚴重，即需做好控制傳染源，以控制疾病的傳播。如當年的SARS及2012年出現的MER，即中東呼吸綜合征，其感染者癥狀均較明顯，需將所有感染者均進行隔離，降低傳播性。但其它的一些呼吸道傳染病，如感冒、流感及新型冠狀病毒肺炎，常有輕型感染者，甚至無癥狀感染者，難以被識別，無法完全控制傳染源。 還要做好第二個環節，即切斷傳播途徑。在流行期間，所有人均需戴好口罩，外出去人多、空氣流通不好場所，均需戴好口罩進行保護。需注意手衛生，盡量避免被患者的呼吸道分泌物污染后用手揉眼睛、摸口鼻。患者糞便、尿液可能也有傳染性，故衛生間也需戴好口罩、經常開窗通風。另外，要注意保護易感人群，流感等呼吸道傳染病已有疫苗，但需每年接種。對新型冠狀病毒預防主要做到隔離傳染源、切斷傳播途徑。