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抗菌藥物治療性應用的基本原則如下：1、盡早確定病原菌：建議盡量在應用抗菌藥物前，從患者感染部位、血液、痰液以及其他部位取樣，進行細菌培養和藥敏實驗，從而針對性地選擇抗生素。若患者感染較重，則可在取樣送培養后根據感染情況推測可能的病原菌，然后給予適當抗生素經驗性應用；2、據藥物抗菌譜選藥：醫生需根據藥物抗菌譜選藥，選擇可在感染部位達到有效濃度的藥物。在選藥時還需綜合考慮患者肝腎功能狀態以及全身狀況，還需考慮細菌耐藥可能性、藥物不良反應、藥物可及性以及藥物價格等，兼顧上述因素后進行科學選藥；3、合理聯合用藥：聯合用藥需具備適當適應癥，聯合后可產生相加或協同作用，以提高療效、減少用藥劑量，同時還可降低藥物毒性和不良反應；4、防止抗菌藥物使用不合理：患者在病毒感染時不可使用抗生素，出現原因不明發熱時通常以查明病因為主，而非急于應用抗生素。另外，需盡量避免局部應用抗菌藥物，要選擇事宜藥物劑量并治滿療程；5、特殊人群用藥慎重：對于新生兒、兒童、孕婦以及哺乳期患者而言，選藥需慎重，務必選擇安全藥物。