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如果為慢性胃痛，且經過對癥治療不能緩解，或者通過其他檢查方法無法明確原因時，需要進行胃鏡檢查。胃鏡從口腔伸進入，經過咽喉部、食管到達胃進行檢查。除胃部檢查外，胃鏡還可對病變部位進行活檢。同樣可對活檢病理進行幽門螺桿菌檢測，檢查患者有無幽門螺桿菌感染。胃鏡檢查的適應癥為上腹部不適，包括腹痛、惡心、嘔吐、噯氣、消化道出血。其次不明原因，懷疑有胃部占位性病變時，患者可以做胃鏡檢查明確。 此外，其他少數方法可以進行胃部疾病檢測，如服用造影劑以后進行胃部超聲檢查。其優點為無創，檢查相對較方便。但缺點是不能完全明確胃黏膜病變，且不能做活組織檢查來確定病變性質。膠囊內鏡主要檢查部位為小腸，少數磁控膠囊可以檢查胃、食道病變，缺點為不能做活檢，以及費用昂貴。總之，通常胃部疾病首選胃鏡檢查。