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生長激素是垂體產生，因此缺生長激素與垂體相關。患者多數為繼發性起病，如垂體腫瘤、垂體外傷、腦外科手術，或者因為其他部位腫瘤必須做放療、化療，導致垂體受損，引起生長激素繼發性缺乏。 有些患者天生生長激素缺乏，與垂體也有關，部分患者為先天性垂體發育不良，不僅缺生長激素，垂體產生的其它激素也缺，如促甲狀腺激素、腎上腺皮質激素。如果為孤立性生長激素缺乏，多數與患者自身基因有關，即基因缺陷導致生長激素合成障礙。 嚴重的生長激素缺乏較少見，真正的生長激素缺乏稱為垂體性侏儒，即矮小癥。與甲狀腺激素缺乏引起的呆小癥不同，生長激素缺乏引起的個子矮不影響智力，不像甲狀腺激素缺乏引起的呆小癥，會影響智力。因此需要通過影像學檢查判斷垂體有沒有問題，此外，也要通過激發試驗檢查生長激素是否缺乏。