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治療肺部感染常用的藥物是各種不同類型的抗生素，根據導致肺部感染病原體的不同，所選擇的抗生素也不同。在選擇抗生素之前要分析、判斷導致肺部感染的病原體。病毒感染要選擇相應的抗病毒藥物；不耐藥的革蘭氏陽性球菌、革蘭氏陰性桿菌要選擇廣譜抗生素；大環內酯類敏感的衣原體、支原體、卡他莫拉菌、流感嗜血桿菌、軍團菌等，要選擇相應的大環內酯類抗生素；耐藥的金黃色葡萄球菌要選擇糖肽類抗生素，如萬古霉素、替考拉寧、利奈唑胺等；如果分析判斷可能是產ESBL陽性的碳青霉系列，敏感的腸桿菌組感染導致，可選擇碳青霉系列抗生素；結核桿菌導致要選擇相應的抗結核藥；真菌感染，無論是白色念珠菌、非白色念珠菌、隱球菌、曲霉菌、毛霉菌等，要選擇相應的抗真菌藥物，必要時需聯合多種抗生素治療多種細胞混合感染導致的肺部感染。總之在治療肺部感染時，常選用抗生素，依據分析判斷導致其感染的病原體，合理選擇各種不同類型的抗生素。