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人體的消化系統是各系統里所含器官比較多的系統，從食物進入口腔以后，唾液腺的分泌是一種消化功能，也可以屬于消化系統。之后從咽喉部開始，食管、胃、十二指腸、小腸、空腸、結腸，結腸又分為升結腸、橫結腸、降結腸、乙狀結腸，之后是直腸、肛門，均屬于消化系統器官。另外，兩處重要的消化附屬腺，即肝臟和胰腺，肝臟下方的膽囊也屬于消化系統。所以消化科所負責治療的疾病包括食道的炎癥、腫瘤、潰瘍，胃和十二指腸潰瘍、炎癥、幽門螺桿菌感染、小腸病變、結腸病變、肝炎、膽囊炎、肝臟囊腫以及腫瘤等，包括胰腺炎、胰腺腫瘤，均屬于消化內科的疾病范圍。不同的醫院分科也不同，比如部分醫院可能會將胃腸科和肝膽科單獨區分。