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肺炎衣原體抗體通常是由于肺炎刺激機體產生，所以兒童衣原體肺炎抗體陽性可以支持診斷，同時可為機體提供防御作用。患兒初次感染3周后即可出現IgM抗體，6-8周后出現IgG抗體，若患兒再次感染或重復感染，則1-2周會出現IgG抗體。因此，若想要明確診斷，建議患者查IgG抗體以及IgM抗體。此外，抗體產生還與個體差異相關，如患兒抵抗力較強，則抗體產生較強、較快，陽性率較高且消退較慢，此時抗體的存在更有利于預防疾病反復發作。在恢復期患者通常無需復查抗體，因為此時抗體不會對患兒造成任何傷害。