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大腸桿菌又稱為大腸埃希菌，是革蘭氏陰性桿菌，想要殺滅大腸埃希菌，需要用廣譜抗生素或應用針對革蘭氏陰性桿菌的藥物，都能夠殺死。常用藥物有喹諾酮類藥物，如甲磺酸、左氧氟沙星、鹽酸左氧氟沙辛或可洛比托等，可以口服也可以靜點，是首選藥物。但是注意14歲以下兒童，不建議用喹諾酮的藥物，可以選擇青霉素類藥物，青霉素類藥物也是廣譜藥物，對大腸桿菌也有明確的殺滅效果，對于泌尿系感染、膽道感染以及呼吸道感染都有明確的療效。大腸桿菌是革蘭氏陰性桿菌，所以頭孢類的藥物，頭孢三代、頭孢四代也有殺滅作用。開始確定診斷時不能殺雞用牛刀，因為頭孢三代、四代是高級別的抗生素，如果用喹諾酮類藥物效果不佳，又不能用青霉素類藥物，可以選擇頭孢三代、頭孢他啶等進行治療。大腸桿菌有時會通過擴張的腸黏膜，屏障功能受限的腸黏膜進入到腹腔，引起自發性腹膜炎，此時要聯合用藥，進行足療程治療。大腸桿菌可以隨著膽道進入到膽囊，引起急性膽囊炎，所以用頭孢他啶時，可能會加用甲硝唑或替硝唑等抗厭氧菌感染的藥物。泌尿系感染最常見的致病菌也是大腸桿菌，所以也是首選喹諾酮類的藥物進行治療。