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先天性白內障主要為遺傳導致，先天性白內障的遺傳有較多機制，比如隱性遺傳，即隔代遺傳，以及顯性遺傳，如父母有先天性白內障，小孩也明確有先天性白內障。先天性白內障的遺傳主要與基因有關，父母或者隔代親人將遺傳基因傳給患者。或者父母都有攜帶基因，將先天性白內障遺傳給患者。 除基因以外，部分患者不一定完全遺傳，如媽媽在懷孕時感染病毒，發熱或使用相關藥物等，也會引起嬰兒白內障。比如風疹病毒感染，媽媽在懷孕期間感染風疹病毒，也會導致生出的嬰兒有先天性白內障。