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免疫組化應用非常多，最主要的作用在癌癥中，有90％以上的癌癥可以通過免疫組化的方法得到比較明確的診斷，并且可以指導癌癥的治療。但是免疫組化的應用并不僅僅是癌，從廣義來說，免疫組化還可以用在非常多的應用當中，具體如下： 1、幫助判斷腫瘤是良性還是惡性，即是不是癌； 2、在淋巴結中看到有癌組織，能判斷癌癥來源。可以幫助判斷來源于肺癌，還是來源于結腸癌； 3、能夠具體分型診斷，比如淋巴瘤是比較大的稱呼，有非常多的亞型，要知道哪種亞型需要免疫組化支持診斷； 4、幫助判斷微小的癌轉移，微小癌組織用眼睛很難看到，免疫組化可以通過特殊方法勾勒出幾個細胞； 5、可以幫助進行進一步治療指導，比如乳腺癌，可以通過ER、PR、Her-2的免疫組化方法知道激素含量指導該不該用內分泌治療，或者該不該用赫賽汀靶向治療。