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器質性疾病和功能性疾病最簡單的區分方法，是有無腫瘤，或者有無明確原因的疾病。如果女性出現不規則出血，可以找到原因，比如因肌瘤、息肉，或者女性凝血系統有問題，這些均能明確找到原因，稱為器質性疾病。如果無法明確原因，前提是排除器質性病變后，如進行B超檢查，發現無贅生物，檢查血液系統，無凝血功能障礙，則大多數是因內分泌失調所導致，這類病因稱為功能性疾病。如果腹瀉或腸梗阻是腫瘤所導致，則屬于器質性疾病。但是如果進行B超、造影以及各種消化道檢查，如胃鏡、腸鏡，并未發現原因，則考慮是腸道蠕動功能異常所導致。這種疾病屬于功能性疾病，功能性疾病的嚴重程度小于器質性疾病。