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甲狀腺穿刺基本上可以診斷所有類型的甲狀腺癌組織，包括乳頭狀癌、濾泡性癌、髓樣癌、低分化或未分化和其他少量類型的癌。甲狀腺的穿刺檢查，是診斷甲狀腺疾病中最常見的一種診療手段，在甲狀腺腫瘤診斷中非常有價值。但甲狀腺穿刺在診斷甲狀腺癌時存在一定困難，尤其在分型診斷時，主要通過細胞的異型性，如核大、濃軟，或者細胞的排列，包括雜亂排列，以及有沒有核內包含體等情況來診斷甲狀腺癌。在甲狀腺癌里最常見的就是甲狀腺乳頭狀癌，其他類型的癌癥加起來總數不超過10%，所以其實甲狀腺穿刺主要診斷的是甲狀腺乳頭狀癌。在診斷甲狀腺乳頭狀癌時的精準率，與取標本的量和組織有一定的關系，甲狀腺穿刺很難達到100%的精確率，但如果穿刺成功，對于診斷甲狀腺癌還是比較可靠的。