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流行性乙型腦炎最主要的傳染源是蚊蟲，研究得比較多的是三帶喙庫蚊。除了三帶喙庫蚊之外，研究發現還有其它種類的蚊蟲，也是流行性乙型腦炎最重要的傳染源。流行性乙型腦炎是蟲媒傳染的腦炎，除了三帶喙庫蚊，還有豬、涉水的飛禽，也是這個病毒存在的重要環境。通常三帶喙庫蚊在叮咬了攜帶有病毒的豬，或者是這些涉水的鳥類，再去叮咬人的情況下，人就成為這個病毒的最終宿主，從而出現流行性乙型腦炎。但是人身上攜帶的病毒載量通常比較小，因此在這樣的情況下，即使是蚊蟲叮咬了這個人，再到其他的人，往往不會造成流行性乙型腦炎的傳播。所以，流行性乙型腦炎最主要的傳染源是三帶喙庫蚊，還有豬和涉水的鳥類，也是這個病毒很重要的宿主和載體。流行性乙型腦炎通常好發的季節，是夏季還有秋季。