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不明原因的發熱原因比較復雜。急性發熱原因以感染性疾病為常見，從感染部位分類，有呼吸道感染、泌尿系感染、腸道感染，這三個是最常見的社區獲得性感染，其它還包括皮膚軟組織感染、骨關節感染和血流感染。從導致感染的病原體角度，包括細菌感染、病毒感染、及不典型病原體感染等。此外，非感染因素，比如中暑、中毒、手術、創傷都可以引起不同程度的發熱。對于急性感染性發熱的患者，通常需要完善血常規、C-反應蛋白、還有尿常規、胸片或者胸部CT，必要時還要做腹部B超，查找感染部位，評估可能引起感染的病原體。 發熱還有更復雜的原因，比如如果發熱持續3周以上，體溫多次＞38℃，或者在一天內體溫波動＞1.2℃，而且經過較多檢查不能確診，這種稱為發熱待查，其病因非常復雜。包括感染性疾病，如病毒、細菌、不典型病原體、真菌、結核等，還包括結締組織病，如狼瘡、系統性血管炎等。還有腫瘤性疾病，包括血液系統腫瘤和實體腫瘤。還有一些其他原因，包括藥物熱、周期熱、溶血等。發熱待查的病因需要結合病情分層檢查，通常先進行血常規、尿常規、C-反應蛋白、血沉、生化、血培養，以及其他的病原學檢查，還要做自身抗體相關的檢查、甲狀腺功能檢查、腫瘤相關的篩查，還有HIV梅毒篩查等。同時還需要對患者的免疫功能進行評估，行腹部和胸部的檢查，以及淺表淋巴結的超聲。 如果以上檢查還不能確診，一些患者是需要做PET-CT掃描和淋巴結活檢的侵入性操作。由于病情的復雜和動態變化，如上述的這部分檢查可能需要重復地進行。需要強調的是，對于發熱待查系統的病史采集和體格檢查，對診斷疾病也非常重要，不能單純的以某種檢查或者是某些檢查來代替身體不明原因的發熱，首先是要及時就醫，由專業的醫生進行診治。