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頭顱核磁共振檢查，目前可以檢查顱內的部分占位性病變，比較前沿的腦功能檢查，也屬于頭顱核磁共振檢查的一部分。除能夠檢查頭顱部的解剖結構異常改變外，頭顱核磁共振檢查可以檢查出腦功能異常的問題，如心理疾病的腦改變、阿爾茲海默在腦部的功能改變等。在沒有禁忌的情況下，頭顱核磁共振檢查可以為臨床提供很多的幫助。臨床頭顱核磁共振，檢查的范圍可以包括顱底到頭頂部，主要的解剖結構包括顱底骨、鞍區、鼻竇、眼眶、眼球、腦、腦血管以及脊髓的頸部、顱骨、頭皮軟組織。頭顱核磁共振檢查有各種檢查序列，針對不同的疾病可以采用不同的檢查序列。就疾病而言，頭顱核磁共振檢查最常見的檢查疾病是腦血管疾病、腦腫瘤，腦部外傷、癲癇，發育不良、智力低下等。另外對于眼部疾病、耳部疾病以及鼻咽部疾病，也可以通過頭顱核磁共振檢查來明確病因。