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系統性紅斑狼瘡為臨床上可出現多種自身抗體的自身免疫病，最重要或標記性抗體如下：1、抗史密斯抗體：為系統性紅斑狼瘡特異抗體，敏感性相對較低約30%，即可存在30%紅斑狼瘡患者出現該抗體，特異性較高。一旦出現該抗體，除非為假陽性或檢測有誤情況，通常指向系統性紅斑狼瘡診斷，抗史密斯抗體滴度不受疾病活動度變化而改變，查出陽性后無需根據抗史密斯抗體是否為陽性判斷疾病是否存在活動；2、抗雙鏈DNA抗體：可見于極少數其它結締組織病，但于系統性紅斑狼瘡特異性亦較強，且抗雙鏈DNA抗體與疾病活動度存在相關性。抗雙鏈DNA抗體陽性在系統性紅斑狼瘡疾病活動度評分(SLEDAI評分)中占2分。對于部分狼瘡腎炎患者，亦可表現為抗雙鏈DNA抗體陽性，因此與臟器損傷密切相關。