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因引起膿毒血癥的病原菌不同，小兒的抵抗力不同，所以膿毒癥痊愈的時間也不同。若是輕度的膿毒血癥，通常2周可以痊愈，但多數小兒是新生兒，或因燒傷、抵抗力極低、或感染特殊病原菌等引起的膿毒血癥，治療的時間將延長。特殊病原菌通常對普通的藥物不敏感，所以需要先培養患兒的血液或局部細菌培養，再進行藥敏試驗，進而選擇敏感抗生素進行治療。但多數細菌培養和藥敏試驗需要3天，甚至1周。在此期間，由于感染十分特殊，沒有對此敏感的抗生素進行治療，通常將處于無效治療中，只有當藥敏試驗結果出來后，選用有效抗生素，1-2周可見好轉。所以根據病原菌的毒性不同，所引起的感染不同，而治療的病程也將出現差異，部分小兒因自身抵抗力低下以及病原菌毒性特殊，可能出現遷延反復，甚至遷延幾個月的情況。