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陰道菌群失調的癥狀多與陰道炎癥狀非常類似，可表現陰道局部干澀、瘙癢、紅腫、疼痛、性生活異常不適。并可表現為白帶異常，比如顏色、量以及質地的變化，以上癥狀均由陰道菌群失調所造成。大部分陰道菌群失調則是由于治療陰道炎時選擇藥物不當所引起，即醫源性菌群失調。 陰道炎可由不同的細菌和病原菌感染所造成，比如霉菌、念珠菌性陰道炎由白色念珠菌造成，滴蟲性陰道炎由滴蟲造成，細菌性陰道病則是由于細菌感染引起。發生陰道炎時，需要明確病原菌類型，且針對病原菌采用特異性的藥物進行治療。若采用廣譜抗生素或者廣譜殺菌劑，其不僅對正常致病菌有殺滅作用，對陰道正常菌群亦可起到殺滅作用。這種情況則會導致反復復發，并導致菌群失調。正常的菌群對于抑制陰道炎發作具有非常重要的作用，所以應盡量避免采用廣譜抗生素或消毒劑、殺菌劑治療陰道炎，而要采用窄譜抗生素進行治療。