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自身免疫性肝炎的診斷在免疫性肝病里比較復雜。自身免疫性肝炎主要好發于女性，而且在輕度的時候，患者往往沒有任何的表現。很多病人是在體檢的時候發現轉氨酶升高，再做進一步檢查。此病主要是以轉氨酶升高、γ-球蛋白血癥和自身抗體陽性來進行診斷。此病具體診斷步驟如下： 1、患者如果有轉氨酶升高，ANA抗核抗體、抗線粒體抗體、抗平滑肌抗體、抗肝腎微粒體抗體陽性，則傾向于患者有自身免疫性肝炎； 2、自身免疫性肝炎診斷的金標準其實是肝臟穿刺組織活檢術，即取一塊肝組織進行病理檢測，如果有淋巴細胞浸潤、玫瑰花環樣的特征性病理表現，就可以明確診斷自身免疫性肝炎。一旦發現轉氨酶升高，且進一步檢查也不是傳染性肝病，如果考慮是免疫性肝病，自身抗體沒有陽性的表現，就要進行肝穿來確診，因為自身抗體的陽性率并不是很高。因此自身免疫性肝炎的診斷比較復雜，需一步一步的檢查，最主要的是檢查自身免疫性抗體的指標。