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糖尿病有一部分情況和免疫系統疾病有關。一般常見的2型糖尿病，大部分和遺傳、胰島素抵抗、基因、環境有關，而一部分1型糖尿病和部分特殊類型的糖尿病和免疫系統有關。1型糖尿病的致病原因里很重要的組成部分就是自身免疫性疾病，此情況下和免疫有關，出現免疫破壞后即可引起此疾病，即胰島素缺乏。還有部分特殊類型的糖尿病，此類特殊類型的糖尿病也有一部分還是和免疫系統有一定關系。另外，部分免疫系統的疾病，如結締組織病和自身免疫性疾病。在獲得上述自身免疫性疾病的過程中，也有可能會破壞胰腺功能，出現血糖異常。此外，若在免疫系統的部分疾病治療過程中，應用免疫調節藥物，如免疫抑制劑，或在腫瘤的免疫治療、運用糖皮質激素等，會出現繼發性糖尿病，這種情況下也會出現血糖異常。