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診斷肝癌重要的指標包括抽血化驗指標，以及影像學的標準。對于肝癌經典的血清學標志物是甲胎蛋白，英文簡稱AFP，主要是由肝癌細胞合成。另外，在少數情況下，肝功能衰竭后新的再生肝細胞也可以合成甲胎蛋白，所以甲胎蛋白明顯升高，或者短期之內出現迅速動態的升高，是診斷肝癌重要的參考指標。對于肝臟，首選的影像學方法，即肝臟彩超，或者肝臟CT、肝臟核磁檢查，在必要的情況下，可以進行肝動脈造影，可以發現占位的存在。另外，還要結合患者是否具有慢性肝病病史，絕大多數肝癌患者是發生于慢性肝病基礎之上，比如肝硬化，或者慢性肝病、慢性肝炎，大多數肝臟沒有基礎病的患者很少會直接得肝癌。