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嬰兒出現先天性畸形原因，主要見于以下方面：1、遺傳因素：可能由于遺傳因素所致，如果嬰兒爸爸、媽媽存在先天畸形問題，嬰兒生后也易發生畸形問題，常屬于染色體顯性遺傳問題。也存在部分嬰兒爸爸、媽媽并無問題，但屬于各自致病基因攜帶者，此時嬰兒也易出現先天畸形問題；2、藥物或化學因素：可能由于媽媽在懷孕期間接觸到部分物質所引起，比如媽媽服用特殊藥物或者接觸化學物質等，均易引起嬰兒生長發育異常，從而引起嬰兒發生先天畸形問題；3、感染因素：如果媽媽在孕期出現感染，尤其為病毒感染如巨細胞病毒感染或者風疹病毒感染等，可以導致嬰兒出現先天發育畸形問題；4、輻射因素：如果媽媽在孕期接觸較多放射線、輻射，可能會對嬰兒生長發育構成影響，從而引起發育畸形問題。