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肺部疾病通常無法通過核磁進行檢查，因為肺臟屬于含氣的器官，而核磁檢查對于含氣器官的敏感性較差。所以診斷肺部的疾病通常不進行核磁檢查，而需進行胸部CT檢查，胸部CT對于肺部病變較為敏感。但對于部分肺血管疾病，如肺血栓栓塞癥，則可進行核磁檢查。肺部疾病包括肺部疾病以及肺血管疾病，肺臟疾病無法通過核磁進行檢查，而肺血管的部分疾病可以應用核磁進行檢查。所以在對患者進行肺部疾病檢查時，醫生通常會要求進行胸片或胸部CT的檢查而并非核磁檢查。雖然核磁是應用較廣的檢查方法，在某些疾病的檢查中優于CT檢查，但對于肺部的疾病，胸部CT優于核磁檢查。