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正常人的糞便中含有大量細菌，所以糞便標本的檢驗必須是在混有大量正常菌的菌群中選出病原菌，需要注意大便的正確采集和運送，以提高檢查的陽性率。具體采集方法如下： 1、用藥前在干燥的清潔便盆內自然排便，避免使用坐式或蹲式馬桶，避免因污染影響檢驗結果； 2、采集帶有膿血黏液部分的大便2-3g，約黃豆大小； 3、采集外觀無異常的糞便，應從糞便表面不同部位取材； 4、采集液體糞便的絮狀物1-2ml，放入無菌的便盒中送檢； 5、排便困難或者嬰幼兒患者，尤其是檢測患有腹瀉后溶血性尿毒綜合征的嬰幼兒，可用直腸試紙法采集標本。采集方法是用無菌試紙蘸取生理鹽水濕潤，由肛門插入約2-4cm，輕輕的在直腸內旋動，取出大便少許，標本采集后應盡快送檢，如培養志賀氏菌應于30分鐘內送檢。