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流行性乙型腦炎的主要傳染源是蚊子，屬于蚊蟲傳播，其中間宿主是豬、牛等，蚊子可以和蛙類或者蜘蛛等昆蟲、蟲類，以及兩棲動物進行病毒保存。像豬或者牛這些家禽類動物，被蚊蟲叮咬之后，乙型腦炎病毒就在其體內進行繁殖，進行繁殖之后出現短暫的病毒血癥，但是在豬身上很少會出現明顯的臨床表現或者比較重的表現。其他的蚊子又通過叮咬有這種病毒的豬或者牛等家禽來傳染給人類，人類主要就會表現出流行性乙型腦炎的臨床表現，比如發熱、痙攣性無力等，流行性乙型腦炎主要是感染10歲以下的兒童。