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類風濕因子是類風濕關節炎的分類標準之一，但并非唯一標準，不具有特異性。也可作為血清陰性脊柱關節病的區分標準，類風濕因子與其他蛋白、半抗原有交叉反應，病后半年才產生持續高效價類風濕因子。 部分類風濕關節炎患者測不出IgM類風濕因子，需進一步檢查IgG類風濕因子和IgA類風濕因子，類風濕因子效價越高，對類風濕關節炎診斷特異性越高。 但類風濕因子也可出現在其他自身免疫性疾病及感染性疾病方面，如細菌性心內膜炎、結核等。 另外，非感染性疾病如彌漫性肺間質纖維化、肝硬化、慢性活動性肝炎、結節病等也可出現類風濕因子陽性情況。