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尿路感染是一個很大的概念，臨床上根據感染的部位分上尿路感染和下尿路感染。檢查項目首先是尿常規檢測，其次是中段尿培養。培養方面可根據患者的臨床表現，考慮病人是細菌感染為主，還是合并有支原體或真菌、結核菌感染，然后做中段尿的不同微生物檢查。一般常見尿路感染多半是細菌感染，所以常見是做中段尿的細菌培養。另外，還有一些病人合并有真菌、支原體或者合并結核感染，可以相應的做中段尿的微生物檢查，主要是做尿中段尿的微生物培養，對于診斷泌尿系感染或診斷尿路感染非常重要。還有影像學方面的檢查，影像學方面最常規的，最簡便、最無創、最經濟的是泌尿系彩超。泌尿系彩超可以判斷腎臟的形態，腎盂、腎盞有沒有積水，包括輸尿管和膀胱的情況。彩超檢查也是運用最廣的一個檢查。還有一個影像學檢查是靜脈腎盂造影，對于有腎結石病史，做了彩超或懷疑有腎結石，又合并有泌尿系感染的病人，把感染控制好后，有必要去做靜脈腎盂造影，了解整個泌尿系的情況，對判斷泌尿系感染的部位、原因和指導以后的治療都很有幫助。還有一些檢查如薄層CT掃描適合于懷疑有復雜性尿路感染、尿路梗阻或泌尿系有占位的病人。此外，還有核磁共振檢查。核磁共振沒有CT快，而且CT對泌尿系顯示得很清楚，必要的時候會給病人做泌尿系的CT檢查。