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CT檢查在神經科，即完成頭部的CT平掃，懷疑腦出血或者蛛網膜下腔出血等出血性疾病時，首選CT檢查。因為CT對出血性疾病非常敏感，CT上突然出現的高密度信號、高密度病變，則可能提示是出血性的改變或者鈣化，與以前的圖像對比，可很快判定是否存在出血的情況。對于腦血管病，如腦梗，發病6小時左右，CT即可顯示比較大的病灶。即使是在早期，也有征象提示，比如皮髓質界限不清，大腦中動脈高密度征等，有助于判斷。CT與核磁相比，優勢為CT的檢查受到的限制較少，比如有心臟起搏器、人工關節等情況下，仍然可以進行CT檢查，但這一類患者可能無法進行核磁的檢查。CT檢查用時較短，對于病情比較危重的患者，短時間的篩查也比較適合用CT完成。