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病理活檢最重要的意義是做出明確的診斷，給臨床進行指導和治療提示。常見的醫學書上會提到病理醫生是醫生的醫生，病理診斷是金標準。 雖然金標準并不是完全意義上的金標準，但對目前的診斷和治療來說，病理診斷是非常重要的依據。比如胃腸鏡活檢是否能提示癌前病變，宮頸組織活檢等都是發現惡性病變的最好方式。此外，如果確定為惡性病變，切除下來的手術標本也必須做病理組織學檢查，病理報告中給臨床各種提示信息，比如腫瘤類型、分級、范圍、累及到周圍器官情況等，對臨床治療、預后都起到非常重要的指導作用。 隨著目前分子病理的發展，結合分子基因檢測，病理活檢能更好地實現金標準的作用。