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對于葡萄球菌感染首選的藥物，要結合患者感染的部位分析。不同感染部位，藥物的濃度有所區別，首選的藥物也會存在差異。具體如下：一、社區或院內感染：1、社區感染：葡萄球菌的感染如果是社區獲得，病情相對比較輕，有可能不是耐藥的細菌感染。此時可以首選頭孢唑林，也可以選擇苯唑西林；2、院內感染：如果患者是院內感染，尤其病情比較重，此時可能就要選擇針對耐藥的葡萄球菌感染，首選萬古霉素、替考拉寧、利奈唑胺或者是達托霉素，一般會首選萬古霉素。對于患者如果有腎功能不全的情況下，可以考慮應用利奈唑胺或者應用替考拉寧，對于患者如果皮膚軟組織感染非常嚴重，也可以選用達托霉素。二、感染部位：不同部位感染選擇的抗菌藥物也有所區別，具體如下：1、血流感染：一般如果是考慮敗血癥，是血流的感染，一般不會選擇利奈唑胺。因為利奈唑胺對于血流的感染濃度相對不是很高，一般首選萬古霉素；2、中樞神經系統感染：但如果是中樞神經系統的感染，替考拉寧一般不能夠透過血-腦屏障，所以一般不會選擇替考拉寧治療中樞神經系統的感染；3、肺部感染：如是葡萄球菌引起的肺部的感染，此時不能夠選擇達托霉素。因為達托霉素在肺中，肺表面的活性物質會對于達托霉素進行滅活，就不會發揮抗感染的作用。