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C肽和胰島素的關系非常密切，是從胰島β細胞同時分泌出來，即分泌多少胰島素也會分泌多少C肽，兩者在血中的濃度應該是等比例。但胰島素經過門脈系統進入肝臟會有首過效應，會損失到50%，而C肽水平在血中相對比較穩定，所以可能會用C肽反映基礎的胰島功能狀態。有些患者使用胰島素治療后，因為正常測定很難鑒別，到底是自己生成還是外源注射的胰島素。通過測定C肽水平，就可以更好了解胰島β細胞的功能狀態，因為這時血中的胰島素不能更好反映胰島狀態，可能C肽的意義更加明確。對于大多數人，C肽和胰島素水平非常密切，兩者捆綁在一起由β細胞分泌。基本可以反映正常人β細胞的分泌狀態，可以反映基礎胰島功能，包括給予負荷后基礎胰島功能有多大的釋放能力，來反映胰島功能狀態。