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肝膽磁共振對于肝膽占位性病變，以及肝臟、膽道形態學改變，均有重要作用。磁共振為臨床較有效檢查，通過掃描后可以發現肝臟或膽道出現占位性病變，或者在病理性因素下引起肝臟充血、水腫、纖維化，甚至肝硬化等，發現后需采取相應治療。如果屬于內科性原因，如病毒、酒精、藥物等造成急性肝損傷，肝臟可能表現為充血、水腫狀態，早期可能出現纖維化，晚期可能會出現肝硬化情況。此時需根據病因進行治療，如抗病毒、戒酒、停止使用藥物等方法。而在外科方面可以發現患者是否存在膽道結石、膽囊結石或者腫瘤、肝臟占位性或結節性病變，是否需要進行外科手術治療等情況，如需要手術進行膽道通暢引流，甚至肝葉、肝段切除等，從而緩解患者癥狀。