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抗組蛋白抗體指針對體內染色質當中的組蛋白所產生的一種抗體，抗組蛋白抗體在非藥物誘導的紅斑狼瘡患者中陽性率可以達到70%左右，在沒有并發癥的類風濕關節炎的患者當中，陽性率可以達到40%左右。但抗組蛋白抗體滴度的高低和疾病的活動度沒有明顯關系，而在一些類風濕的特殊類型當中，比如三體綜合征以及類風濕關節炎相關的血管炎患者當中，也可以檢測出抗組蛋白抗體陽性。在一些非風濕的自身免疫性疾病中，如原發性膽汁性膽管炎的患者，有70%左右的患者抗組蛋白抗體是陽性，而且大部分都是針對H1抗體。很多藥物都可以引起來類似系統性紅斑狼瘡的疾病，叫做藥物性的狼瘡，病情都較系統性紅斑狼瘡輕，而且停止藥物以后癥狀可以消失。而藥物性狼瘡這一類患者的抗組蛋白抗體陽性率比較高，在95%以上，是藥物狼瘡的特異性的抗體。