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細菌感染和病毒感染可從以下方面進行區別：1、病變性質：細菌和病毒均可引起上呼吸道感染，但細菌引起的病變主要以化膿為主，可引起扁桃體紅腫、有膿點。但病毒感染一般是非化膿性病變，亦可引起扁桃體的紅、腫，但一般不會出現膿點；2、化驗結果：細菌感染時常有白細胞、中性粒細胞升高，同時降鈣素原(PCT)會明顯升高。而病毒感染白細胞常在正常水平甚至下降，PCT(降鈣素原)可輕度升高，但多數均為正常。病原學檢查是診斷細菌感染和病毒感染的金標準，若為細菌感染，從感染部位取材或做血培養可培養出細菌，而病毒感染的細菌培養為陰性。病毒感染的患者可通過檢測病毒的核酸，以及病毒的特異性IgM、IgG抗體來進行診斷；3、治療方法：病毒感染用抗生素治療無效，細菌感染則需用抗生素進行治療，經過抗生素治療，炎癥可以得到控制，發燒等癥狀可緩解。