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羊水穿刺染色體異常胎兒，部分可以保留但部分不能保留，因為羊水穿刺要對46條即23對染色體中每一條染色體進行檢測。明確疾病后，根據不同疾病判斷胎兒是否可以保留，常見如下所示：1、21-三體綜合征：若患兒存在21-三體綜合征，則不能保留胚胎，因患21-三體綜合征患兒出生以后生活無法自理；2、5號染色體異常：若5號染色體某一片段出現問題，出現貓叫綜合征可能影響存活，因此不能保留；3、部分染色體異常：如45xO即X染色體缺失一條，但胎兒發育正常，稱特納氏綜合癥，胎兒可以存活則可以保留；4、性染色體異常：對于47XYY或47XXX，稱超雌綜合征、超雄體綜合征，此種性染色體異常的胎兒多數可以存活。因此，染色體異常需觀察類型以及片段缺失、重復，是否為微缺失、微重復以及是否可能致病等，建議咨詢遺傳專家后決定胎兒保留與否。