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免疫系統疾病主要分為特異性免疫系統疾病和非特異性免疫系統疾病，常見分析如下： 1、特異性免疫系統疾病：針對某個器官、某個組織產生的自身抗體，造成特異性的免疫性疾病，如亞甲炎，即針對甲狀腺產生抗甲狀腺球蛋白抗體，作用在甲狀腺上，造成甲狀腺的功能損害引發的癥狀，如1型糖尿病，針對胰島細胞產生的抗體。2、非特異性免疫系統疾病：如風濕性疾病，風濕科主要研究彌漫性的結締組織病，主要是針對全身各器官、各系統產生的抗體、結合補體，主要是以免疫反應為主，如系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎、干燥綜合征、皮肌炎、多肌炎、硬皮病，以及一大類的系統性血管炎，主要特點是彌漫性、全身性，且抑制性較強，與血管炎癥密切相關，治療上主要是激素治療。