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兒童腦寄生蟲感染常見的有腦囊蟲病、腦型血吸蟲病、腦型肺吸蟲病、包蟲病及腦型瘧疾等。檢查包括血常規、糞常規、腦脊液檢查、免疫學檢查、胸腹部CT、頭顱磁共振檢查等。腦囊蟲感染時，血常規中白細胞總數可以正常，但個別患者會出現白細胞升高、嗜酸性粒細胞增高。 糞便檢查發現絳蟲卵是診斷囊蟲病的依據。腦脊液檢查一般表現為壓力正常或者升高，腦脊液中白細胞增高，以淋巴細胞增高為主，還可以出現嗜酸性細胞增高。免疫學檢查主要是寄生蟲抗體檢查，也可以作為診斷依據。頭顱磁共振能夠發現病變部位，確定病變位置、大小以及病變數目，還可以顯示出腦水腫、腦積水、腦室形態等。胸腹部CT檢查用于尋找體內其它部位的寄生蟲感染灶。