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肺結核是由人型結核分枝桿菌感染所致，主要經呼吸道傳染，也可經消化道傳染，食入帶菌的食物，如含菌牛奶等。少數患者可以經皮膚傷口傳染，但呼吸道傳播是最常見和最重要的傳播途徑。傳染性肺結核病患者主要是痰中帶菌者，從呼吸道咳出大量帶菌飛沫，吸入這些帶菌飛沫即可造成感染。 結核桿菌可以侵入人體任何器官，人體的各種器官除了毛發、指甲等都可以發生結核病，但結核桿菌主要通過人體的呼吸道進行傳播，所以在人體感染結核桿菌后發生肺結核者占絕大多數。人體感染后約5%可發展為活動性肺結核，其中少數患者因免疫低下，可經血和淋巴系統，播散至全身各個部位引起相應的結核病。90%以上的原發感染沒有癥狀，感染病灶形成纖維化或鈣化，不治而愈，但病灶內常仍有一定量的結核分枝桿菌長期潛伏，不但能刺激機體產生免疫，也可成為日后內源性感染的根源。