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腎盂腎炎是尿路感染的一種，叫做上尿路感染，也就是感染位置比較深，達到了腎盂，而不只局限于膀胱。腎盂腎炎的感染病原體往往是逆行感染，從膀胱輸尿管一直播散到腎盂位置。這些細菌最常見的還是通過尿道口的定植的細菌，從膀胱輸尿管逆行感染到腎盂。在尿道口最常見的細菌是大腸桿菌。所以腎盂腎炎最常見的病原體細菌是大腸桿菌感染，往往在腎盂腎炎時做尿培養，最常見的是細菌感染。如果出現了大腸桿菌感染，會根據培養結果進行具有針對性的治療。常用的藥物如左氧氟沙星、環丙沙星、還有頭孢類藥物都可以選擇，這類藥物對大腸桿菌非常明顯。簡單來說，最常見腎盂腎炎的致病菌是大腸桿菌。