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氣管鏡和CT屬于兩種不同檢查，需要根據病情部位，患者是否能夠耐受選擇。氣管鏡需要明確患者有無禁忌癥，兩者無法比較和替代。氣管鏡檢查可以經氣管鏡取到組織，進行病理檢查，很快可以明確診斷。氣管鏡檢查可以取異物，夾除異物或痰栓，或明確氣管有無出血或出血部位。 外周病變氣管鏡會受到局限，無法觀察氣管遠端以及氣管外面病變，此時選擇肺部CT檢查，肺部CT檢查是一種影像學檢查，可以更清楚看到肺部各個部位有無病變，病變大小以及累及范圍。肺部炎癥、結核、肺氣腫、支氣管擴張都能觀察較清楚。低劑量CT常作為肺癌篩查，還可以動態觀察病變發展速度，例如發現腫瘤，經過治療可以觀察腫瘤大小有無變化。CT引導可以對肺周邊病變進行穿刺，目前臨床首先進行肺部CT檢查，明確病變位置，進行影像學特征性分析。再決定是否需要氣管鏡檢查，兩種檢查相輔相成，互相不能取代。