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甲狀腺過氧化物酶抗體不是腫瘤標記物，是慢性淋巴細胞性甲狀腺炎，又稱為橋本甲狀腺炎標記物。患有橋本氏甲狀腺炎時，甲狀腺過氧化物酶抗體和甲狀腺球蛋白抗體都會增高，數值大小不等。數值高低可能跟甲狀腺炎程度相關，甲狀腺癌過氧化物酶抗體和球蛋白抗體不一定高。 要診斷是否為癌，主要通過細胞學檢查判斷，不通過標記物、過氧化物酶抗體判斷。臨床檢查過氧化物酶抗體，主要判斷是否為橋本氏甲狀腺炎。若判斷其是否為腫瘤可通過FNA，即甲狀腺穿刺細胞學檢查確定。