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多種因素都會引起胎兒脊髓圓錐位置低，引起胚胎結構發育的所有因素都會引起，包括染色體問題、早期感染的問題、電離輻射、病毒、微生物等，包括藥物因素，影響胎兒發育的任何因素都可以引起胎兒脊髓圓錐位置低。只是表現點不一樣，有的是表現在其他幾個問題，有的就表現出脊髓發育的問題。另外，神經系統的發育伴隨著整個孕期，甚至在出生后一段時間，所以更強調在整個孕期都要避免這些不良因素，對胎兒的神經系統發育的影響。隨著孕周的增加，脊髓圓錐的位置要上移，在20周的時候，會判斷脊髓圓錐與腰椎、骶椎的關系。隨著孕周的增加，脊髓圓錐的位置會逐漸上移，快速上移階段在17-27周，會從與腰椎平行的階段上升到腰3階段，后面從27-37周，會上升到腰椎的1、2階段。