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冷凍切片可以讓外科醫生在手術過程中馬上了解病變性質，以便及時確定手術范圍，并且做出相應處理。冰凍切片組織在離體后必須盡快送檢，不可固定，保持新鮮，也不可以沾水，以免在冰凍時形成冰晶，影響觀察。常規切片及染色最少需要3天時間，而快速冰凍切片的時間制片加診斷只有30分鐘，要在如此之短的時間內做出診斷，難度還是相當高，取材也有局限性，因此制作切片的質量也不如常規石蠟切片高。 因而冰凍切片的確診率比常規切片要低，達到90%即為優秀。冰凍切片有一定的延遲診斷率和誤診率，不能作為最終診斷的依據，只可作為外科醫生手術中的參考，所以冰凍切片尚不能廣泛應用，應在術前力求通過常規病理檢查明確診斷。部分患者常規病理檢查結果不滿意，或病灶的位置特殊，如靠近大血管等，無法做常規病理檢查的，可以選擇性應用術中快速冰凍，但是事后仍需用常規石蠟切片對照和存檔。