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腦部CT和腦部核磁共振的優勢不一樣，具體如下：1、腦CT：優勢在于非常快、方便，禁忌證比較少。對于急性的缺血性腦血管病而言，一定要遵從大夫的醫囑。如果考慮有靜脈溶栓指征，要首先進行腦CT的檢查，最節約時間。同時腦CT對出血很敏感，如蛛網膜下腔出血、腦出血，陽性率可以達到99%以上；2、腦核磁共振：由于序列非常多，且有不斷的新序列開發，所以相對于腦CT看得更加仔細。但是每增加一個序列，做的時間就會延長，同時對一些特殊的序列還需要后期處理，所以使用方式不一樣。對于腦CT沒有發現病灶的腦梗死，同時也不考慮過急的靜脈溶栓治療之外，可以考慮腦核磁共振的檢查。或者對于醒后卒中需要明確是否有灌注的不匹配，可以進行頭部核磁共振的檢查。同時要鑒別是新發還是陳舊病灶，可能通過腦核磁共振可以更加準確。腦核磁共振還可以完善非增強的血管成像，來初步判斷腦血管的情況。所以以上這些情況建議進行頭部核磁共振的檢查，但是頭核磁共振檢查也有禁忌證，比如體內有一些不能進行核磁共振檢查的金屬、鋼板、支架、釘子、關節等，或者是有幽閉恐懼癥的人，可能不能配合頭核磁共振的檢查。