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胃鏡檢查幽門螺桿菌是否準確，依情況而定。一般情況下，從胃鏡下觀察有沒有幽門螺桿菌感染，可以根據胃黏膜的表現判斷。如果有幽門螺桿菌感染，可出現胃炎的特征，感染后會造成胃黏膜變化的特征，因此可推測有幽門螺桿菌感染。 其次可以用試劑檢測是否存在幽門螺桿菌，常用的有快速尿素酶試驗。即在做胃鏡的時候，取一塊胃黏膜組織，化驗是否有幽門螺桿菌感染。但是幽門螺桿菌在胃部并不是呈均勻彌散，而是呈局灶性的特征。即對一塊胃黏膜取樣，發現有幽門螺桿菌感染，可判斷是陽性。但如果沒有對病變部位胃黏膜取樣，則提示為陰性，所以即使是陰性也不能排除有幽門螺桿菌感染，要結合是否有幽門螺桿菌感染引起的胃黏膜炎癥特征綜合評估。故可通過胃鏡的黏膜表現加快速尿素酶試驗，來判斷有沒有幽門螺桿菌感染。除此之外可以病理切片化驗，如果在病理上發現胃黏膜有幽門螺桿菌，即可診斷幽門螺桿菌感染。 綜上而言，胃鏡檢查幽門螺桿菌，應結合鏡下胃炎的特征、快速尿素酶檢查結果，和病理上是否有幽門螺桿菌而定。三者綜合考量后，其準確率比較高。如果單從某一個方面來說，準確性有一定誤差。