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肝癌的診斷不是靠肝功能，肝功能的異常表現和肝癌沒有直接的相關性。當然肝癌大多數是在慢性肝病基礎上形成，所以肝癌也可以合并有轉氨酶的異常升高，堿性磷酸酶、轉肽酶、膽紅素也可以出現升高，但是肝癌也可能肝功能完全正常。對于肝癌的診斷主要是通過腫瘤標志物、影像學檢查來確診，腫瘤標志物主要是指甲胎蛋白，影像學則是指增強CT、增強核磁，必要的時候還需要通過肝臟腫瘤穿刺活檢。而肝臟功能主要是和肝臟疾病，尤其是慢性或急性肝臟疾病引起的肝損傷所致的異常。肝功能指標包括反映肝細胞破壞的轉氨酶、反映膽道梗阻的轉肽酶、堿性磷酸酶，以及反映膽紅素代謝轉化的膽紅素水平。另外凝血功能指標在嚴重的肝病也會出現異常，所以肝功能指標對應的是肝臟自身問題，反映肝細胞破壞的嚴重程度，和腫瘤沒有直接相關性。