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CK5/6實際上是細胞角蛋白的指標，無法單純通過這個指標陽性或者陰性，來判斷預后的好壞，也存在一些器官特異性的差別。一般CK5/6陽性時，通常傾向于鱗癌的可能性更大，除此以外還有一些鱗癌特殊的標志，在這種情況下要組合分析來判斷具體是什么樣的情況。如果CK5/6是陰性，有時可能存在鱗癌、腺癌或者其他類型時，更有助于進行相關判斷。在臨床上免疫組化的各項指標檢測非常重要，其中CK5/6聯合其他的比如p40、p63，還有一些TTF-1、CK7陽性以及CK20等，可以進一步判斷比如肺癌具體的病理類型。針對病理類型判斷后，最主要能夠為后續治療提供相應更有針對性的方案，能夠在病理類型的指導下明確治療的策略，從而進一步提高病人的生存期，改善生活質量。所以在臨床上并不能單純地通過某一個免疫組化的指標，來判斷預后好壞與否，還要聯合、綜合地分析判斷。