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結核菌即結核分枝桿菌，主要侵犯肺臟，稱為肺結核病，也可以侵犯肺臟以外的其他部位，如肝、腎、腦、淋巴結等器官，稱為肺外結核病。治療結核菌的感染，應選用化學藥物，其他的治療方法，如對癥治療、手術治療等均為輔助治療。化療的目標不僅在于殺菌和防止耐藥性的產生，而且在于最終滅菌、防止和杜絕復發，因此化療應遵循當前國際公認的化療原則，即早期、聯合、適量、規律、全程。肺結核的治療相比其他類型的細菌感染，可能需要更長的時間。活動性肺結核患者需服用抗結核藥物至少6-9個月，具體藥物和治療時間取決于患者的年齡、整體的健康狀況和耐藥情況等，常用的藥物包括異煙肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等。此外，治療過程中應實施全程的監督化學治療管理，肺結核患者在治療過程中，每次用藥都必須在醫務人員或經培訓的家庭督導員的直接監督下進行。因故未用藥時必須采取補救措施，以保證按醫囑規律用藥，這種方式可以提高治療的依從性和治愈率，并減少多耐藥病例的發生。